iPhone Apps「魚眼フォト」などで使っている方法です。
いいと思います。
-(UIImage*)cropImage:(UIImage *)img rect:(CGRect)rect{
    CGImageRef imgref=CGImageCreateWithImageInRect([img CGImage],rect);
    UIImage *result=[UIImage imageWithCGImage:imgref];
    CGImageRelease(imgref);
    return result;
}
//元の画像
UIImage*img=[UIImage imageNamed:@"hoge.png"];
CGRect*rect=CGRectMake(0.0, 0.0, 10.0, 20.0);

//切り取った画像
UIImage*cropimg=[self cropImage:img rect:rect];